Działania restrukturyzacyjne władz Uniwersytetu spowodowały oburzenie i protesty części społeczności akademickiej, której członkowie postanowili się zorganizować. W maju założyli Tymczasową Komisję Zakładową OZZ “Inicjatywy Pracowniczej”. Jej członkowie, których liczba stale rośnie, podejmują szereg działań o charakterze informacyjnym, interwencyjnym i mobilizacyjnym społeczność akademicką do stawania w obronie zagrożonych praw i wolności pracowniczych w Uniwersytecie. Współpracują też z Państwową Inspekcją Pracy, która aktualnie prowadzi w uniwersytecie nadzwyczajną kontrolę. Pierwsze efekty interwencji i wniosków składanych przez przedstawicieli Komisji na ręce inspektora PIP są już widoczne, ponieważ rozpoczął się długo wyczekiwany proces likwidacji tzw. umów śmieciowych |(umów o pracę na czas określony), na których w Uniwersytecie pracuje aż połowa wszystkich nauczyciel akademickich.

Komisja upomina się nie tylko o przestrzeganie prawa pracy w Uniwersytecie, ale także działa w obronie demokratycznych procedur funkcjonowania Uczelni, na którym nieustannie dochodzi do naruszania statutu. Prowadzi też szeroko zakrojoną akcję informacyjną skierowaną do pracowników Uniwersytetu, m.in. poprzez publikowanie Newslettera a także stronę na Facebooku [Fanpage Komisji na Facebooku]. Najważniejszą akcją informacyjną o charakterze ogólnopolskim była zakończona wielkim sukcesem inicjatywa zbierania podpisów pod “Petycją w obronie Uniwersytetu Pedagogicznego im. KEN w Krakowie”, którą podpisało ok. 3000 osób z Polski i zagranicy [Zobacz petycję]. Komisja Zakładowa była też współorganizatorem głośnego protestu pod hasłem “Ciemność widzę...przeciw ideologizacji edukacji i nauki”, który odbył się w Krakowie 17 czerwca br.